Γιος του βασιλιά του Ορχομενού Βοιωτίας, Αθάμαντα και της Ωκεανίδας Νεφέλης, εγγονός του Αιόλου και αδελφός ης Έλλης. Για να γλυτώσουν τα δυο αδέλφια από την κακιά μητριά τους Ινώ, έστειλε η μάνα τους Νεφέλη τον ιπτάμενο Χρυσόμαλλο Κριό για να τα μεταφέρει στην Κολχίδα. Καθώς πετούσαν πάνω από τη θάλασσα η Έλλη έχασε την ισορροπία της και έπεσε στο πέλαγος όπου την κράτησε ο θεός Ποσειδώνας. Από τότε η θάλασσα αυτή ονομάσθηκε Ελλήσποντος.
Ο Φρίξος συνέχισε την πορεία του και ο Κριός τον έφερε στην Κολχίδα, όπου ο βασιλιάς Αιήτης τον δέχθηκε πρόθυμα και του έδωσε ως σύζυγο τη θυγατέρα του, Χαλκιόπη.

Έπειτα, ο Φρίξος θυσίασε το χρυσόμαλλο κριό στον βωμό του Δία και δώρισε το δέρμα του (δέρας) στον Αιήτη. Εκείνος το αφιέρωσε στον Άρη και το κρέμασε από μια δρυ, στο ιερό δάσος του θεού. Προς φύλαξή του τέθηκε ένας μεγάλος δράκος, ο οποίος δεν κοιμόταν. Το χρυσόμαλλο δέρας ήταν αργότερα ο στόχος της Αργοναυτικής Εκστρατείας.